阿克塞哈萨克族自治县人民检察院重建于1979年，现有11个内设科室，分别为：办公室、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、公诉科、侦查监督科、监所检察科、职务犯罪预防科、民事行政检察科、控告申诉科、法警队、案件管理办公室。编制15人，实有干警14人。院领导班子有4名成员，其中检察长1人，副检察长2人，反贪局局长1人。中层干部6人，副主任科员2人，具有检察官资格的9人，书记员2人，司法警察2人，工勤人员1人。

　　近年来，阿克塞县检察院坚持“强化法律监督，维护公平正义”检察工作主题，积极发挥职能作用，为自治县经济社会转型跨越发展提供强有力司法保障,队伍建设、业务工作取得了可喜成绩。先后被省检察院评为“五好检察院”、“人民满意的检察院”，被省检察院荣记“集体二等功”，被酒泉地委、行署命名为“地级文明单位”；连续两年被酒泉市人民检察院评为“先进检察院”、“学习型检察院”、“检察宣传先进集体”；连续多年被阿克塞县委、县政府授予“普法先进集体”、“综合治理先进单位”、“文明单位标兵”、“诚信示范单位”、“先进党支部”等荣誉称号。6名干警荣记“个人三等功”，多名干警先后获得“全省检察机关计财先进个人”、“优秀共产党员”、“巾帼建国标兵”、“优秀党务工作者”、“综治先进个人”、“检察宣传先进个人”等荣誉称号。